El IBA se fundó en el 1964 como instituto de capacitación bíblica para pastores y obreros para el creciente pueblo evangélico. Desde 1994 es incorporado por la Facultad de Teología de la Universidad Evangélica del Paraguay.
El IBA es patrocinado por las Iglesias de los Hermanos Menonitas del Paraguay. Su versículo lema es Salmo 119:105 – “Lámpara es a mis pies tu palabra y lumbrera a mi camino”.